Kontainer wird heute sowohl von der Universität Kopenhagen, der Gemeinde Aarhus, der dänischen Naturschutzbehörde, ATP, Djøf uva. als digitale Bibliothek und Filesharing-System verwendet. Aufgrund des zentralen Fokus von Kontainer auf die Sicherheit bei der gemeinsamen Nutzung und Weitergabe von Dateien entscheiden sich viele Behörden für Kontainer. Kontainer wird in einer eigenen professionellen Cloud-Installation betrieben, die sich in 2 Hosting-Zentren in Kopenhagen befindet. Der Inhalt wird durch ein tägliches Backup mit einer Wiederherstellungsoption von 80 Tagen gesichert.